有机无机复合肥作为一种新型肥料，正成为今后生态农业用肥的发展方向。这里主要论述该肥料中氨基酸在农业上的应用。
氨基酸可对土壤进行改良。促进土壤团聚体的形成：土壤团聚体是土壤结构的基本单位。使用氨基酸，可改变土壤中含盐过高、碱性过强、土粒高度分散、土壤结构性差的理化性状，绥化增产肥，促进土壤团聚体的形成，施用氨基酸后，土壤容重明显下降，土壤总孔隙度和持水量相应增加，有助于提高土壤保水保肥的能力，从而为植物根系生长发育创造良好的条件。
国内外大量研究资料证实，施用氨基酸可使纤维分解菌等菌的数量增加。对加速有机物的矿化，马铃薯增产肥，促进营养元素的释放有利。
施用商品有机肥，应重视肥料的成分。目前市场供应的商品有机肥，蔬菜增产肥，大多数是利用有机物料进行高温发酵制成的。经充分发酵后制出的有机商品肥，大豆增产肥，不仅不会发出臭味，有的甚至还会带有某种特殊的香味；可有些使用者错误地认为购买的商品有机肥如不带臭味就质量不高，这是一种认识误区。其实只有那些未经充分发酵的产品才会有难闻的臭味。市场上供应的有机肥，对其有效养分的含量都有明确的标示，在选用时要根据不同作物种类选择养分对路的产品，以适应蔬菜生产的需求。
化学肥料在生态农业中对作物的增产增收起着至关重要的作用，科学的施肥技术和水肥管理使养分的利用率大大提高，作物的营养品质、土地的输出产能、农田的生态环境等在科学施肥的调控下得以改善。
在21世纪的今天，现代农业进入快速发展的新轨道。绿色农业、环保农业、低碳农业已成为农业发展的主流。
以水体富营养化为例，说明在农田养分中科学施肥的巨大作用。在水体富营养化中起关键作用的是氮素和磷素。农田生态系统氮循环在某些环节上与碳循环相伴存在并具有相似之处，碳氮循环相互影响、相互促进。
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